داستان انیمیشن آرک درباره یک باستان‌شناس قرن بیست و یکم به نام "هلنا" است که یک روز از خواب بیدار شده و خود را در جزیره‌ای مرموز به نام آرک می‌بیند که توسط دایناسورها احاطه شده است. حال هلنا باید یاد بگیرد زنده بماند و متحدان جدیدی پیدا کند، اما ...